费用方面
费用过高：企业对银行收取的保函费用有疑问，觉得费用过高或者收费标准不透明，不同银行的收费标准差异较大，企业可能不清楚费用是如何计算的，增加了财务成本。
费用争议：在保函办理过程中，可能会出现一些额外费用，如加急费、修改费等，企业事先未了解清楚，导致与银行产生费用争议。
其他方面
风险评估不当：银行对企业的风险评估不够准确，可能导致保函金额过高或过低。金额过高会增加企业的费用支出，金额过低则可能无法满足项目需求或不符合相关要求。
银行政策变化：银行可能会根据市场情况、监管要求等因素，调整保函业务的相关政策和审批标准，导致企业原本符合条件的申请变得不符合要求，或需要补充更多的材料和手续。
短期保函：期限在 3 个月以内的短期保函，收费相对较低，一般为保函金额的 0.5‰-1.5‰左右。如 3 个月期限、100 万元的投标保函，费用可能在 500 元 - 1500 元。
长期保函：期限在 1 年以上的长期保函，银行承担风险时间长，收费会较高，可能达到保函金额的 1%-3% 左右。比如 2 年期限、500 万元的履约保函，费用可能在 5 万元 - 15 万元。
信用良好的申请人：银行信任度高，可享受较低手续费率，可能比标准费率低 20%-50%。例如原本收费比例为 1%，信用良好的企业可能只需支付 0.5%-0.8%。
信用不佳的申请人：银行会提高收费标准或要求额外担保措施，手续费率可能比标准费率高 50%-，如标准费率为 1%，可能会提高到 1.5%-2%。